Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms