Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms