Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms