Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms