Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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