Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms