Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms