Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms