Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TPCN1Q9ULQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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