Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms