Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms