Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms