Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms