Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARPBPQ9NWS1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms