Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms