Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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