Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCM1Q9NP62 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms