Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms