Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCAS3Q9H6U6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms