Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms