Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12CQ9C0D7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms