Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms