Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms