Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms