Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSPO3Q9BXY4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms