Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLVAPQ9BX97 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms