Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms