Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF4Q9BRK5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms