Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCA3Q99758 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA3Q99758 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms