Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms