Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms