Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYCBPQ99417 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms