Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms