Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms