Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms