Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms