Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms