Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CELF6Q96J87 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms