Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms