Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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