Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms