Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms