Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms