Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms