Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms