Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms