Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms