Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms