Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms