Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms